Vários fatores podem afetar a precisão de um satélite:

Erros de Posição e medida de tempo dos Satélites: São geralmente baixos, devido a alta precisão dos equipamentos do satélite e ao fato da força aérea monitorar constantemente o funcionamento dos mesmos, corrigindo eventuais erros.
Erros na medida de tempo dos receptores: São bastante significativos, porém este erro é mitigado pela referencia de tempo obtida do 4º satélite.

Refração na Ionosfera/troposfera: ao penetrar na atmosfera terrestre o sinal do satélite sofre difração resultante da mudança de meios, o que altera sua trajetória e velocidade. A ionosfera e a troposfera afetam a onda de maneiras distintas devido a primeira ter grandes quantidades de partículas carregadas e a segunda ter muita umidade. Este erro é mais grave quando o satélite se encontra perto do horizonte (em relação ao receptor) pois a onda deve percorrer um percurso maior.

Multi-path error: ocorre quando o sinal do satélite é refletido por um ou mais obstáculos (como um prédio), fazendo com que o receptor enxergue mais de um sinal. Como o sinal refletido possui intensidade menor que o original, o receptor pode facilmente desconsidera-lo.

Selective Avaiability: Consiste na inserção intencional de erro, na transmissão da hora e/ou posição do satélite com o intuito de impedir a utilização do GPS para calibragem de precisão em mísseis por pessoas não autorizadas. Esta opção é mantida desligada usualmente.